Bicaudaviridae
Bicaudaviridae | ||||||||||||||||
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Bicaudavirus | ||||||||||||||||
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Taxonomische Merkmale | ||||||||||||||||
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Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||||||
Bicaudaviridae | ||||||||||||||||
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Bicaudaviridae ist die offizielle Bezeichnung einer Familie von Viren mit Doppelstrang-DNA-Genom. Ihre natürlichen Wirte sind hyperthermophile Archaeen der Familie Sulfolobaceae im Phylum Thermoproteota (mit Gattungen Acidianus, Sulfolobus, Saccharolobus)[A. 1] Derzeit (Stand Mitte März 2021) gibt es in der Familie Bicaudaviridae vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigt nur die eine Gattung Bicaudavirus mit der Typusart Acidianus two-tailed virus (ATV).[2][3][1]
Der Name leitet sich ab von den lateinischen Wörtern bi und cauda ab, was so viel wie Zweischwanz oder Doppelschwanz bedeutet.
Aufbau[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Die Virionen (Virusteilchen) der Bicaudaviridae sind möglicherweise umhüllt und haben eine zitronenförmige Geometrie. Das Genom ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem zirkulär geschlossenen dsDNA-Molekül mit einer Länge von etwa 62 kbp (Kilobasenpaaren). Es hat 72 offene Leserahmen (en. open reading frames, ORFs).[3]
Reproduktionszyklus[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Die Reproduktion der Viren erfolgt im Zytoplasma der Wirtszellen. Der Eintritt in die Wirtszelle (Infektion) erfolgt durch Anlagerung der Virus-Proteine an Wirtsrezeptoren, wodurch eine Endozytose vermittelt wird. Die Virus-DNA dient als Vorlage für die Transkription (en. DNA-templated transcription). Der Austritt aus der Wirtszelle erfolgt durch Knospung (en. budding). Die Übertragung der Virusteilchen geschieht durch passive Diffusion.[3]
Forschungsgeschichte[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Die Familie Bicaudaviridae wurde erstmals von dem Team um D. Prangishvili im Jahr 2005 beschrieben.[4][5]
Systematik[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Die Systematik ist nach ICTV (Master Species List #35: Offiziell anerkannte Taxa)[1] und National Center for Biotechnology Information (NCBI – Vorschläge, in doppelten Anführungszeichen)[6][7] mit Stand Mitte März 2021 wie folgt:
Gruppe: dsDNA (Baltimore: 1)[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Familie: Bicaudaviridae
- Gattung: Bicaudavirus
- Gattung „Betabicaudavirus“[11]
- Spezies: „Sulfolobus-Virus STSV1“ (englisch „Sulfolobus virus STSV1“ alias „Sulfolobus tengchongensis spindle-shaped virus 1“, STSV-1)[12]
- Spezies: „Sulfolobus virus STSV2“ (en. „Sulfolobus virus STSV2“ alias „Sulfolobus tengchongensis spindle-shaped virus 2“, STSV-2)[13]
- ohne Gattungszuordnung:
- Spezies: „Acidianus tailed spindle virus“ (ATSV-1)
- Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV1“ (SMV-1)[8]
- Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV2“ (SMV-2)
- Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV3“ (SMV-3)
- Spezies: „Sulfolobus monocaudavirus SMV4“ (SMV-4)
Die beiden vorgeschlagenen Species STSV1 und STSV2 sind wohl zu unterscheiden von den beiden ICTV-bestätigten Spezies
der Gattung Alphafusellovirus in der Familie Fuselloviridae.
Anmerkungen[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
- ↑ Einige Gattungen von Sulfolobus (offenbar aber nicht S. tengchongensis) wurden in neuerer Zeit nach Saccharolobus verschoben:
- LPSN: Saccharolobus, Sulfolobus, S. shibatae, S. solfataricus
- Hiroyuki D. Sakai, Norio Kurosawa: Saccharolobus caldissimus gen. nov., sp. nov., a facultatively anaerobic iron-reducing hyperthermophilic archaeon isolated from an acidic terrestrial hot spring, and reclassification of Sulfolobus solfataricus as Saccharolobus solfataricus comb. nov. and Sulfolobus shibatae as Saccharolobus shibatae comb. nov, in: Int J Syst Evol Microbiol 68(4), April 2018, S. 1271–1278, Epub 27. Februar 2018, doi:10.1099/ijsem.0.002665, PMID 29485400
- Anh Le-Cook, James Musser: Sulfolobus/Saccharolobus, Extreme Viruses Lab (Stedman Lab)
Weblinks[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Weiterführende Literatur[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
- Mart Krupovic, Emmanuelle R. J. Quemin, Dennis H. Bamford, Patrick Forterre, David Prangishvili: Unification of the globally distributed spindle-shaped viruses of the Archaea. In: Journal of Virology. 88. Jahrgang, Nr. 4, 2014, ResearchGate:259320195, S. 2354–2358, doi:10.1128/JVI.02941-13, PMID 24335300, PMC 3911535 (freier Volltext) – (englisch).
- Fengbin Wang, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Matthijn Vos, Leticia C. Beltran, Mark A. B. Kreutzberger, Jean-Marie Winter, Zhangli Su, Jun Liu, Stefan Schouten, Mart Krupovic, Edward H. Egelman: Spindle-shaped archaeal viruses evolved from rod-shaped ancestors to package a larger genome. In:
- Biophysical Journal, Band 121, Nr. 3, Februar 2022, S. 148a-149a; doi:10.1016/j.bpj.2021.11.1983, ResearchGate:358561680 (englisch).
- Cell, Band 185, Nr. 8, 14. April 2022, S. 1297-1307.e11; doi:10.1016/j.cell.2022.02.019, PMID 35325592, PMC 9018610 (freier Volltext), HAL:03620791, Epub 23. März 2022 (englisch).
Einzelnachweise[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
- ↑ a b c d e f g h i j ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
- ↑ David Prangishvili, Mart Krupovic et al.: ICTV Virus Taxonomy Profile: Bicaudaviridae. In: The Journal of General Virology. 99. Jahrgang, Nr. 7, 7. Juni 2018, S. 864–865, doi:10.1099/jgv.0.001106, PMID 29877786 (englisch).
- ↑ a b c Viral Zone. Expasy, abgerufen am 18. März 2021 (englisch).
- ↑ Häring M, Vestergaard G, Rachel R, Chen L, Garrett RA and Prangishvili D (2005) Independent virus development outside a host. Nature 436, 1101–1102
- ↑ Prangishvili, D., Vestergaard G, Häring M, Aramayo R, Basta T, Rachel R and Garrett RA (2006) Structural and genomic properties of the hyperthermophilic archaeal virus ATV with an extracellular stage of the reproductive cycle. J. Mol. Biol. 359, S. 1203–1216
- ↑ NCBI: Bicaudaviridae (family)
- ↑ Andrew M. Kropinski, Stuart G. Siddell: ICTV: ICTV Report Bicaudaviridae, Mai 2018
- ↑ a b
Fengbin Wang, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Matthijn Vos, Leticia C. Beltran, Mark A. B. Kreutzberger, Jean-Marie Winter, Zhangli Su, Jun Liu, Stefan Schouten, Mart Krupovic, Edward H. Egelman: Spindle-shaped archaeal viruses evolved from rod-shaped ancestors to package a larger genome. In:
- Biophysical Journal, Band 121, Nr. 3, Februar 2022, S. 148a-149a; doi:10.1016/j.bpj.2021.11.1983, ResearchGate:358561680 (englisch).
- Cell, Band 185, Nr. 8, 14. April 2022, S. 1297-1307.e11; doi:10.1016/j.cell.2022.02.019, PMID 35325592, PMC 9018610 (freier Volltext), HAL:03620791, Epub 23. März 2022 (englisch).
- ↑ NCBI: Acidianus two-tailed virus 2 (species)
- ↑ NCBI: Acidianus two-tailed virus variant 1 (species)
- ↑ Mart Krupovic, Emmanuelle R. J. Quemin, Dennis H. Bamford, Patrick Forterre, David Prangishvili: Unification of the globally distributed spindle-shaped viruses of the Archaea. In: Journal of Virology. 88. Jahrgang, Nr. 4, 2014, ResearchGate:259320195, S. 2354–2358, doi:10.1128/JVI.02941-13, PMID 24335300, PMC 3911535 (freier Volltext) – (englisch).
- ↑ NCBI: Sulfolobus virus STSV1 (unclassified species)
- ↑ NCBI: Sulfolobus virus STSV2 (unclassified species)
- ↑ NCBI: Sulfolobus spindle-shaped virus 1 (ICTV accepte species)
- ↑ NCBI: Sulfolobus spindle-shaped virus 2 (ICTV accepte species)